食管鳞癌患者血浆与肿瘤组织DNA甲基化检测的应用价值
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【摘 要】目的 研究食管鳞癌患者肿瘤组织和血浆多基因甲基化状态及其对食管鳞癌诊断的应用价值.方法 用甲基化特异性聚合酶链反应(methylation specific polymerase chain reaction,MSP)检测76例食管鳞癌患者肿瘤组织、配对癌旁正常组织、患者术前1d、术后7d血浆游离DNA中腺瘤性息肉瘤基因(adenomatous polyposis coli,APC)、维甲酸受体β2基因(retinoic acid receptor-beta2,RARβ2)、上皮细胞钙黏蛋白基因(E-cadherin,CDH1)、细胞周期蛋白依赖激酶抑制剂4A家族p16基因(cyclin-dependent kinase inhibitor4A,p16INK4α)、Ras相关家族蛋白1A基因(ras association domain family member 1A,RASSF1 A)甲基化,选取同期60名年龄、性别匹配的健康志愿者血浆DNA作对照.用x2检验分析各类组织与血浆标本中5个基因DNA甲基化率的差异;血浆与食管鳞癌组织标本DNA甲基化的相关性用Spearman相关分析;绘制受试者操作特征(receive operating characteristic,ROC)曲线评价单基因与5个基因联合检测诊断食管鳞癌的敏感度、特异度.结果 食管鳞癌组肿瘤组织中的APC、RARβ2、CDH1、p16INK4α、RASSF1A基因甲基化阳性率分别为44.7% (34/76)、72.4%(55/76)、72.4%( 55/76)、86.8%( 66/76)、55.3% (42/76),均显著高于对应癌旁正常组织[6.6%(5/76)、3.9% (3/76)、3.9% (3/76)、3.9% (3/76)、2.6%( 2/76),x2值分别为29.01、75.39、75.39、105.34、57.18,P均<0.001].食管鳞癌组术前血浆中5个基因的甲基化阳性率分别为42.1%(32/76)、63.2% (48/76)、63.2% (48/76)、71.1% (54/76)、50.0%( 38/76),均显著高于健康对照组[3.3% (2/60)、3.3%(2/60)、1.7%( 1/60)、3.3% (2/60)、1.7% (1/60),x2值分别为26.88、51.62、55.01、63.48、38.30,P均<0.001].食管鳞癌患者血浆与肿瘤组织中5个基因甲基化的符合率均较高(Kappa值分别为0.679、0.791、0.791、0.5
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