应用Ion Torrent半导体测序技术检测常染色体显性多囊肾患者PKD1基因致病突变
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【摘 要】目的基于IonTorrent半导体测序技术建立常染色体显性多囊肾患者PKD1基因致病突变检测方法并评价其临床应用价值。方法遗传病分子诊断。收集2013年7月至2014年8月在南京市妇幼保健院就诊的多囊肾患者5例,提取外周血DNA,采用9个长链PCR反应特异性扩增PKD1基因全部编码区,PCR产物混合后进行酶切,经模板制备、乳液PCR和磁珠颗粒富集,应用IonTorrent个体化基因组测序仪进行PKD1基因测序,对发现的致病突变通过Sanger测序验证。结果应用IonTorrent半导体测序技术检测到4例患者存在PKD1基因致病突变,分别为外显子12微小缺失突变(C.2966_2970delCGGCG),外显子15微小缺失突变(C.50145015delAG),内含子23剪接位点突变(c.8972—2A〉G),外显子36错义突变(c.10675G〉A)。结论基于长链PCR技术和IonTorrent半导体测序技术,建立了常染色体显性多囊肾病基因诊断方法,该方法能够特异性检测PKD1基因致病突变,具有较高的临床应用价值。
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